Родилась в городе Александрия, ныне Кировоградской области Республики Украина, в купеческой семье.

В 1892 году закончила гимназию в Полтаве, а в следующем году поступила на Высшие (Бестужевские) женские курсы в Санкт-Петербурге. 

Во время учёбы включилась в активную революционную деятельность, а приезжая домой, в Александрию, вела революционную пропаганду среди местной молодёжи. Также во время учёбы, работала учительницей в вечерней школе. 

В 1896 году была арестована по делу "Союза борьбы за освобождение рабочего класса". После освобождения оставалась под полицейским надзором. 

Жена революционера Анатолия Ванеева. После его ареста и ссылки в 1897 году, отправилась за ним в Сибирь.

Принимала участие в совещании 17 социал-демократов во главе с Лениным, где был принят «Протест российских социал-демократов», направленный против «экономистов». 

После смерти мужа в 1899 году, вышла замуж за его брата - революционера Василия Ванеева.

С 1902 года жила в Нижнем Новгороде. 

После революции проживала в селе Бор Нижегородской губернии (ныне - город Нижегородской области), где работала педагогом. На Бору она организовала первый детский сад. 

Умерла от тифа, ухаживая за больными детьми и была похоронена на Напольном кладбище села Бор. 

Память: 1 июня 1972 года около Дворца культуры завода «Теплоход» (Бор, улица Ленина, 152 - расположенного на территории бывшего Напольного кладбища) состоялось открытие кенотафа Труховской-Ванеевой. На здании бывшего детского сада № 1 по улице Ленина, 54 (ныне детсад не функционирует) установлена памятная доска.